O Instituto Superior de Engenharia foi fundado em 1852, no tempo de Fontes Pereira de Melo, ministro das Obras Públicas, do Comércio e da Indústria, que lançou o primeiro sistema público de ensino industrial, assente na ideia de educação para o desenvolvimento, onde a matriz do ISEP, a Escola Industrial do Porto foi uma das duas primeiras.

Em 1974, através do decreto-lei 830/74 de 31 de Dezembro converteram-se os Institutos Industriais em Institutos Superiores de Engenharia e em 1989 o Instituto Superior de Engenharia do Porto é integrado no subsistema de Ensino Superior Politécnico.

Em 2006, por força da adesão de Portugal à Declaração de Bolonha, o ISEP disponibiliza um novo Plano de Estudos, constituído por licenciaturas e mestrados nas diversas áreas da Engenharia, assim iniciando um novo ciclo da sua já longa história.